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mercredi 21 septembre 2016

Pouvez-vous distinguer vos microbes personnelles?

Pouvez-vous distinguer vos microbes personnelles?
Les communautés animées de microbes dans et sur votre corps sont uniques à vous - si bien qu'ils pourraient être utilisés pour vous identifier à partir d'une foule de centaines d'autres personnes, une nouvelle étude suggère.
Les chercheurs ont analysé les données de plus de 200 personnes qui avaient des échantillons prélevés dans les selles, la salive, la peau et d’autres sites du corps, dans le cadre d'une étude sur le microbiome humain. L’utilisation d’un programme informatique, les chercheurs ont ensuite créé des «codes» sur la base des espèces de bactéries et d’autres microbes trouvés sur une personne en particulier, ainsi que les gènes de ces microbes.
Ils ont constaté que l'utilisation de ces codes, ils étaient en mesure de distinguer la plupart des personnes dans l'étude de centaines d'autres. En outre, lorsque les chercheurs ont examiné des échantillons prélevés sur les mêmes personnes entre un mois et un an plus tard, environ 30 pour cent de la population pourrait encore être identifié à partir de leurs codes initiaux.
Les codes basés sur les microbes vivant dans les entrailles des gens ont été particulièrement stable - environ 80 pour cent des personnes pourrait encore être identifié sur la base de leurs microbes de l’intestin jusqu'à un an plus tard. 
 Les chercheurs ont été en mesure d'identifier les personnes en fonction de leur ADN pendant des décennies, en reliant un échantillon de l'ADN d'une personne à l’un dans une base de données d'ADN "empreintes digitales". Mais la nouvelle étude montre que «le même type de liaison est possible en utilisant des séquences d'ADN des microbes vivant dans le corps humain - pas l’ADN humain nécessaire," co-auteur Eric Franzosa, chercheur en biostatistique à la Harvard School of Public Health de Boston, a déclaré dans un communiqué. 
L'étude est passionnante car elle «suggère nos résidents microbiens uniques sont accordés sur l'environnement de notre corps - notre génétique, l'alimentation et l'histoire du développement - de telle sorte qu'elles collent avec nous et aider à repousser les envahisseurs microbiens moins sympathiques au fil du temps, "a déclaré le co-auteur Curtis Huttenhower, professeur agrégé de biologie et de la bio-informatique de calcul, également à Harvard.
Mais les résultats ont également des implications pour la vie privée des sujets de recherche, car ils montrent que des échantillons provenant de différents sites du corps peuvent être reliées à des personnes sans avoir besoin d'autres informations.
La découverte "ouvre la porte à la connexion des échantillons de microbiome humain entre les bases de données, ce qui a le potentiel d'exposer des informations sensibles du sujet - par exemple, une infection sexuellement transmissible, détectable à partir du microbiome échantillon lui - même», a déclaré Franzosa.
Les chercheurs notent que les codes microbiens ne sont pas aussi bon que les empreintes digitales de l'ADN humain en termes d'identification des individus - la chance d'obtenir une fausse correspondance est plus élevé avec les codes en fonction microbiens qu’elle ne l'est avec de l'ADN. Mais il est possible que les progrès technologiques, la capacité de l'information microbienne pour identifier les individus augmenteront, selon les chercheurs.