La somitogenèse est le processus par lequel les somites sont formés au cours de l'embryogenèse. Les somitomères sont formés d'abord, qui sont des blocs de tissus qui différencient pour former le muscle squelettique, la colonne vertébrale et de la peau des animaux vertébrés essentiellement segmenté.
Les somitomères sont en fait des spirales de mésoderme concentriques qui vont à devenir somites dans le paraxial non segmenté ou le mésoderme présomitique. Le mésoderme présomitique donne alors naissance à une série de paires de somites qui sont identiques en apparence et deviennent du même type de cellule mais qui diffèrent par la différenciation de la structure en fonction de leur arrangement antéropostérieur. Par exemple, les vertèbres thoraciques avoir des nervures, alors que les vertèbres lombaires ne dispose pas des nervures.
La position de chaque somite individu est unique et est pensé pour être déterminé par les (homéotiques) gènes Hox.
Près de deux semaines après l'ovule est fécondé par un spermatozoïde, le mésoderme paraxial commence à devenir segmentée, donnant lieu à une série de bien définis et cubiques blocs - les somites. Ceux-ci forment ensemble le long de la longueur du tronc, à partir de l'arrière de la tête ou la région occipitale. Ces segments contiennent chacune une cavité centrale appelée myocoel, qui est ensuite rempli avec les cellules qui sont en forme de broche et angulaire.
Les somites se trouvent juste sous l'ectoderme côté du tube neural et notochorde. Ils sont liés au mésoderme latéral de la masse de cellules entre les deux. Dans le tronc, huit sont présents dans la région cervicale, douze dans la région thoracique, cinq dans la région lombaire, cinq dans la région sacrée et entre cinq et huit sont présents dans la région coccygienne.
