La protéomique est un domaine en plein essor de la biologie moléculaire qui est concerné par l'approche systématique, à haut débit pour l'analyse de l'expression des protéines d'une cellule ou d'un organisme. Les résultats typiques d'études de protéomique sont des inventaires de la teneur en protéines de protéines exprimées de façon différentielle à travers de multiples conditions.
La cellule répond aux changements internes et externes en régulant l'activité et le niveau de ses protéines; change donc dans le protéome (une collection de toutes les protéines codées dans nos gènes) donner un aperçu de la cellule dans l'action.Protéomique permet de comprendre la structure, la fonction et les interactions de la totalité du contenu de protéine dans un organisme spécifique.
Histoire de la protéomique
Le terme «protéine» a été initialement introduit en 1938 par le chimiste suédois Jöns Jakob Berzelius, un expérimentateur accompli dans le domaine de l'électrochimie. Il voulait décrire une classe particulière de macromolécules qui sont abondants dans les organismes vivants et composé de chaînes linéaires d'acides aminés.
Les premières études sur les protéines qui peuvent être appelées protéomique ont commencé en 1975 avec l'introduction du gel à deux dimensions et la cartographie des protéines de la bactérie Escherichia coli, cochon Guinée et de la souris. Quoique de nombreuses protéines puissent être séparées et visualisées, ils ne pouvaient pas être identifiés.
Les termes «protéome» et «protéomique» ont été forgés dans le début des années 1990 par Marc Wilkins, un étudiant à l'Université Macquarie de l'Australie, afin de refléter les termes «génomique» et «génome», qui représentent l'ensemble de la collection de gènes dans un organisme.
Depuis la première utilisation du terme "protéome", sa signification et la portée ont rétréci. Les modifications post-traductionnelles, les produits d'épissage alternatif, et les protéines insolubles à des techniques de séparation classiques ont présenté un défi à la réalisation de la définition classique du mot.
Aujourd'hui, de nombreux domaines d'étude sont explorés par la protéomique. Parmi eux, des études d'interaction protéine-protéine, la fonction des protéines, les modifications de protéine, les protéines et les études de localisation. L'objectif fondamental de la protéomique est non seulement de localiser toutes les protéines présentes dans une cellule, mais également pour générer une carte complète en trois dimensions de la cellule indiquant leur emplacement exact.
À bien des égards, la protéomique est parallèle à la génomique. Le point de départ pour la génomique est un gène dans le but de tirer des conclusions sur ses produits (c.-à-protéines), alors que la protéomique commence avec la protéine fonctionnellement modifié et travaille vers le gène responsable de sa production.
Types de protéomique
Protéomique études dont le but est de cartographier les protéines présentes dans un organite cellulaire spécifique ou la structure des complexes protéiques sont connus comme protéomique structurale. L'analyse structurale peut aider à l'identification des fonctions des gènes nouvellement découverts, spectacle où les médicaments se lient à des protéines et où les protéines interagissent les uns avec les autres. Les technologies employées dans protéomique structurale sont cristallographie aux rayons X et la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire.
L'étude quantitative de l'expression des protéines entre les échantillons qui diffèrent par certain variable est connue comme la protéomique d'expression. Ce type de protéomique peut aider à identifier les principales protéines trouvées dans un échantillon particulier et protéines exprimés de manière différentielle dans les échantillons connexes, par exemple lorsque l'on compare les tissus malades et en bonne santé. Les technologies telles que 2D-PAGE et spectrométrie de masse sont utilisés ici.
Protéomique fonctionnelle représente un terme large pour de nombreux particuliers, dirigés protéomique méthodologies. La caractérisation des interactions protéine-protéine sont utilisés pour déterminer les fonctions des protéines et de démontrer comment les protéines se réunissent dans de plus grands complexes. Dans certains cas, subproteomes spécifiques sont isolés par chromatographie d'affinité pour une analyse supplémentaire.
