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jeudi 22 septembre 2016

Village à distance a des bactéries de l'intestin inhabituelles

11.000 années d'isolement: Village à distance a des bactéries de l'intestin inhabituelles
Un examen médical des personnes vivant dans des villages reculés de profondeur dans la forêt amazonienne au Venezuela a découvert des détails frappants concernant les microbiomes de ces villageois, les bactéries vivant sur et dans leur corps, une nouvelle étude.
Les villageois semblent avoir les plus hauts niveaux de diversité bactérienne jamais rapportée dans un groupe humain, les chercheurs ont trouvé.
En outre, leurs microbiomes comprennent des bactéries qui ont des gènes qui pourraient les rendre résistants au traitement avec des antibiotiques. Certains de ces gènes pourrait même rendre ces bactéries résistantes aux médicaments synthétiques - une découverte alarmante, étant donné que ces villageois avaient jamais eu de contact avec soit les gens des sociétés industrialisées ou des antibiotiques commerciaux antérieurs à l'étude, les chercheurs ont dit. 
"Ceci est un élément de preuve clair plus que la résistance aux antibiotiques est une caractéristique naturelle du microbiote humain, juste en attente d'être activé et amplifié après l'utilisation d'antibiotiques," étude chercheur Gautam Dantas, professeur agrégé de pathologie et d'immunologie à l'Université de Washington School of Medicine à St. Louis, a déclaré lors d'une conférence de nouvelles jeudi (15 Avril). 
Les villageois Amérindiennes Yanomami ont d'abord été repérés en 2008, par des personnes dans un hélicoptère de l'armée. Le ministère vénézuélien de la Santé régulièrement des visites NewFound communautés, et leur fournit des services médicaux, y compris les vaccins visant à protéger les villageois contre les maladies introduites par des mineurs illégaux et d'autres aventurer dans l'Amazonie, a déclaré l'auteur principal de l'étude, Gloria Dominguez-Bello, professeur agrégé de la médecine translationnelle à l'école de médecine de l'Université de New York.
Pour la nouvelle étude, les travailleurs de la santé ont recueilli des échantillons bactériens provenant des bras, des bouches des villageois et des matières fécales en 2009. Les travailleurs de la santé ont reçu la permission des autorités villageoises et les participants, les chercheurs ont dit. Une personne qui a parlé à la fois Yanomami et espagnol ont aidé à communiquer.
"Rencontres sont sympathiques", a déclaré Dominguez-Bello. En tout, 34 des 54 villageois, âgés de 4 à 50, ont participé à l'étude.
Diversité du microbe
Les bactéries jouent un rôle crucial dans la physiologie humaine - ils influencent la réponse immunitaire, le métabolisme et même comportement, les chercheurs ont dit. Mais on ne sait pas combien le microbiome humain a changé au cours des milliers d'années, depuis le temps avant que les césariennes, les nettoyants ménagers, et les habitudes de vie et alimentaires modernes se généralisa, Dominguez-Bello a dit.
Les Yanomami ont vécu dans un isolement relatif depuis plus de 11.000 ans, lorsque leurs ancêtres sont arrivés en Amérique du Sud, les chercheurs ont dit. Un coup d’oeil à leurs bactéries peut offrir des conseils quant à ce que le microbiome humain ressemblait avant la vie moderne a changé ses caractéristiques, ils ont dit.
Dans l'étude, les chercheurs ont comparé l'ADN des bactéries de la Yanomami à celle des microbes de personnes aux États-Unis et deux autres groupes - les Amérindiens Guahibos au Venezuela, et les communautés rurales du Malawi en Afrique - qui ont tous deux eu des contacts avec les sociétés industrialisées.
Les groupes qui avaient eu plus de contacts avec le monde moderne ont tendance à avoir moins de diversité microbienne, les chercheurs ont trouvé. Les Yanomami dans l'étude avait presque le double du montant de la diversité bactérienne que les gens aux États - Unis, et environ 30 à 40 pour cent plus de diversité que les Amérindiens Guahibos et participants du Malawi, a déclaré le chercheur de l’étude Jose Clemente, professeur adjoint de sciences génétiques et génomiques et de la médecine à l'école Icahn de médecine Mount Sinai à New York City. 
Cependant, la grande diversité a été observée seulement dans la peau et les matières fécales des bactéries du Yanomami. Ils avaient à peu près la même diversité de bactéries orales que les gens aux États-Unis, les chercheurs ont dits.
Résistance antibactérienne
Certains des échantillons de matières fécales des Yanomami avaient des bactéries avec des gènes de résistance aux antibiotiques, y compris les gènes qui rendent les bactéries résistantes aux médicaments synthétiques. On ne sait pas pourquoi les Yanomami ont des bactéries avec ces gènes - 28 gènes de résistance uniques en tout - mais les chercheurs ont dit que les gènes peuvent provenir de bactéries du sol, qui est connu pour contenir des gènes de résistance aux antibiotiques.
Il est également possible que ces gènes peuvent avoir d'autres fonctions dans des bactéries, ou que le Yanomami a eu un contact indirect avec le monde moderne, comme certains d'entre eux avaient des T-shirts, des machettes et des canettes, les chercheurs ont dit.
Alimentaire Yanomami peut être une autre source. Les chercheurs ont appris que les villageois boivent fermenter le manioc, mais n'a pas pris tous les échantillons de la boisson. «Je serais ravi de revenir à la collectivité», de prélever des échantillons de la nourriture, Dominguez-Bello a dit.
Les résultats peuvent aider les scientifiques à apprendre si certains gènes bactériens protègent contre les maladies courantes dans le monde industrialisé, comme le diabète et l’obésité, les chercheurs ont dit. 
"Il est vraiment utile à étirer notre concept de ce qui est le microbiome humain", a déclaré Pat Schloss, professeur agrégé de microbiologie à l'Université du Michigan, qui n'a pas participé à l'étude.
Cependant, Schloss note qu'il est trop tôt pour savoir si l’augmentation de la diversité microbienne conduit à une meilleure santé. Les chercheurs doivent maintenant essayer de comprendre ce que signifie cette diversité pour ces personnes, a-t - il dit.